RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495899.1

MRPL55-233, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 2

Gene MRPL55, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-233	ENST00000495899	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	LAT2	Q9GZY6	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	GMEB1	Q9Y692	573 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899		A0A096LPI6	279 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899		A0A0G2JND7	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899		A0A1W2PP18	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899		H3BML4	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ICMT	O60725	284 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	H6PD	O95479	791 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	NUDT14	O95848	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	IL18BP	O95998	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CSTA	P01040	98 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	C1QC	P02747	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	NR2F1	P10589	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CTSS	P25774	331 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ELK4	P28324	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	OPRM1	P35372	400 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CRAT	P43155	626 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CLDN15	P56746	228 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CHRNE	Q04844	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	TFF3	Q07654	80 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	FUT5	Q11128	374 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CBFB	Q13951	182 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	AGK	Q53H12	422 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	COX20	Q5RI15	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CMIP	Q8IY22	773 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRPL55-233	ENST00000495899	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.15	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.15	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	AGAP5	A6NIR3	686 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	CLIC1	O00299	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	NR5A2	O00482	541 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	OIP5	O43482	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	CRH	P06850	196 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	COX6B1	P14854	86 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	CAPN3	P20807	821 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	ME2	P23368	584 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	PGM1	P36871	562 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	KCNJ10	P78508	379 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	GUCY1A3	Q02108	690 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	FADD	Q13158	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	SKP2	Q13309	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	RGN	Q15493	299 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	MAPK14	Q16539	360 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRPL55-233	ENST00000495899	SYPL1	Q16563	259 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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