RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL3	Q9UH77	587 aa		5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	POMT2	Q9UKY4	750 aa		5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		5.37	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	USP34	Q70CQ2	3546 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	AGAP5	A6NIR3	686 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	C2orf74	A8MZ97	194 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CLDN25	C9JDP6	229 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BN98	237 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730		M0R3G1	203 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA0513	O60268	411 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	UBXN7	O94888	489 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR75	O95800	540 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	LALBA	P00709	142 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CLPS	P04118	112 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SPN	P16150	400 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MAK	P20794	623 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CD40LG	P29965	261 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKAR1B	P31321	381 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SOX3	P41225	446 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CRYBB2	P43320	205 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR3	P46089	330 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	AVPR1B	P47901	424 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PCYT1A	P49585	367 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	EFNA3	P52797	238 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB38	P57729	211 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM11A	P58511	58 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	BTG2	P78543	158 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR5	P85299	388 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CFHR1	Q03591	330 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RELA	Q04206	551 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TGM3	Q08188	693 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CD300C	Q08708	224 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPAN31	Q12999	210 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMED1	Q13445	227 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	FHL1	Q13642	323 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP1A4	Q13733	1029 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF846	Q147U1	533 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAM2	Q15035	370 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NCF4	Q15080	339 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR68	Q15743	365 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	INA	Q16352	499 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	DECR1	Q16698	335 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	DGUOK	Q16854	277 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	HES3	Q5TGS1	186 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT73	Q86Y46	540 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NRM	Q8IXM6	262 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	PFN4	Q8NHR9	129 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF524	Q96C55	264 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	CRELD1	Q96HD1	420 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM80	Q96HE8	168 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MGLL	Q99685	303 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	TIMP4	Q99727	224 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K3	Q99759	626 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		5.36	□□□□□ -1.55
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		5.36	□□□□□ -1.55

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