RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 AURKCQ9UQB9 309 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 DHRS12A0PJE2 317 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TTLL8A6PVC2 850 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FAAHO00519 579 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 OPN1SWP03999 348 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RAP2AP10114 183 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 THRBP10828 461 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PNMTP11086 282 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CXCR1P25024 350 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RYKP34925 604 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DNASE1L1P49184 302 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TAS2R41P59536 307 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ST3GAL3Q11203 375 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GK3PQ14409 553 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SLC6A19Q695T7 634 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ULK3Q6PHR2 472 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF605Q86T29 641 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CDK20Q8IZL9 346 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CADM2Q8N3J6 435 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TAMM41Q96BW9 452 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ARSGQ96EG1 525 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DSN1Q9H410 356 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MED11Q9P086 117 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 G3V3Y1 287 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ADAMDEC1O15204 470 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HCN1O60741 890 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 PRKD3O94806 890 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 C1QCP02747 245 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF17P17021 662 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HK1P19367 917 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ELK4P28324 431 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 IFNGR2P38484 337 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SLC1A3P43003 542 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CASP6P55212 293 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF117Q03924 483 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DMTNQ08495 405 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SKP2Q13309 424 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MAPK14Q16539 360 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DUSP7Q16829 419 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RAET1LQ5VY80 246 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF613Q6PF04 617 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DEF8Q6ZN54 512 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GRINAQ7Z429 371 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZAR1Q86SH2 424 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 CARM1Q86X55 608 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 C10orf111Q8N326 155 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00471Q8N535 108 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ELOA3Q8NG57 546 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 OR2M3Q8NG83 312 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 RNF138Q8WVD3 245 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SARAFQ96BY9 339 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 DDIT4LQ96D03 193 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 ZG16BQ96DA0 208 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MPP4Q96JB8 637 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 GNRHR2Q96P88 292 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 SEPHS2Q99611 448 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 EPYCQ99645 322 aa8.88□□□□□ -0.99
CTPS1-210ENST00000486889 MCHR1Q99705 422 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms