RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.17■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 NOTCH2Q04721 2471 aa24.17■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 NAV2Q8IVL1 2488 aa24.17■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 NPIPB9F8W1W9 429 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 GUSBP08236 651 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 PGCP20142 388 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 CDKN2CP42773 168 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM44Q2T9K0 475 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 LILRA2Q8N149 483 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 METTL25Q8N6Q8 603 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 LAT2Q9GZY6 243 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM185BQ9H7F4 350 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 SERINC1Q9NRX5 453 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 CALML5Q9NZT1 146 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 PACSIN3Q9UKS6 424 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 ICAM5Q9UMF0 924 aa24.16■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 HMGN4O00479 90 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 UGT2B17O75795 530 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 TGM6O95932 706 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 ELK4P28324 431 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 HBMQ6B0K9 141 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 CBLN3Q6UW01 205 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 PLXDC2Q6UX71 529 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 LUZP2Q86TE4 346 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 OR2V1Q8NHB1 315 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO27Q8NI29 283 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF563Q8TA94 476 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS33AQ96AX1 596 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 MRGPRX4Q96LA9 322 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 MAST4O15021 2626 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 CENPEQ02224 2701 aa24.15■■□□□ 1.46
CCZ1B-211ENST00000486840 H0YC42 278 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA0513O60268 411 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 H6PDO95479 791 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 OPN1LWP04000 364 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 LINGO3P0C6S8 592 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 ZCCHC18P0CG32 403 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 IGFBP2P18065 325 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 CARD18P57730 90 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 FOXF1Q12946 379 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 FOXF2Q12947 444 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 NDUFAF6Q330K2 333 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 OR9I1Q8NGQ6 314 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 FNDC9Q8TBE3 224 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR119Q8TDV5 335 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 FIG4Q92562 907 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 PMM1Q92871 262 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 EBF4Q9BQW3 602 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 TPT1P8Q9HAU6 139 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 MCCC2Q9HCC0 563 aa24.14■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 MED12Q93074 2177 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 PKDREJQ9NTG1 2253 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 NR5A2O00482 541 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 SASH3O75995 380 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC7A1P30825 629 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 SFTPDP35247 375 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 CTBP2P56545 445 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 QPRTQ15274 297 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXW10Q5XX13 1052 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM200AQ86VY9 491 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 OR10D3Q8NH80 312 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 ZFP90Q8TF47 636 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 KLHL15Q96M94 604 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC167Q9P0B6 97 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 EMC9Q9Y3B6 208 aa24.13■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A1W2PNV4 684 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 TUBAL3A6NHL2 446 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 TNFSF11O14788 317 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 UQCRBP14927 111 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 IL7RP16871 459 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 CAPN3P20807 821 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 SIRPAP78324 504 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 KCNJ10P78508 379 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 CHRNEQ04844 493 aa24.12■■□□□ 1.45
CCZ1B-211ENST00000486840 SQLEQ14534 574 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms