RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484031.5

TRO-222, Transcript of trophinin, human

TSL 5

Gene TRO, Length 650 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRO-222	ENST00000484031	SLC35F4	A4IF30	521 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	T	O15178	435 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ACOX3	O15254	700 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	HDAC3	O15379	428 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ZNF708	P17019	499 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ITGA2	P17301	1181 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DRD5	P21918	477 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	IL12B	P29460	328 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SOAT1	P35610	550 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	FAP	Q12884	760 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	NUP43	Q8NFH3	380 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	PIK3R3	Q92569	461 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031		A0A1W2PP18	115 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	KLF11	O14901	512 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SLITRK5	O94991	958 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CD8A	P01732	235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ACP2	P11117	423 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	KRT20	P35900	424 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	PTGDS	P41222	190 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CLDN8	P56748	225 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DSCR9	P59020	149 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DEFA6	Q01524	100 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	NRF1	Q16656	503 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	JADE3	Q92613	823 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	NEUROG1	Q92886	237 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	COL21A1	Q96P44	957 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DUSP26	Q9BV47	211 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DPY30	Q9C005	99 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CHODL	Q9H9P2	273 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CAD	P27708	2225 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ANKRD28	O15084	1053 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	CFLAR	O15519	480 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SCO2	O43819	266 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	TSPAN2	O60636	221 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ICOSLG	O75144	302 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SLC25A16	P16260	332 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	HNF1A	P20823	631 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	DPP4	P27487	766 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	C21orf58	P58505	322 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	UFM1	P61960	85 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TRO-222	ENST00000484031	OGFOD2	Q6N063	350 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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