RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	GALP	Q9UBC7	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	BPTF	Q12830	3046 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SCN9A	Q15858	1988 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541		A0A0J9YWU9	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SDC3	O75056	442 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	MT-ND1	P03886	318 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	GPR89B	P0CG08	455 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ATP6V1C1	P21283	382 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	DLST	P36957	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	BRCC3	P46736	316 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ATP4B	P51164	291 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	RAB35	Q15286	201 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	USH1G	Q495M9	461 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ACER2	Q5QJU3	275 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	UPRT	Q96BW1	309 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	WBP1	Q96G27	269 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	TRIM15	Q9C019	465 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	RMND5A	Q9H871	391 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	AMBN	Q9NP70	447 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	OTOF	Q9HC10	1997 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541		A0A1B0GTH9	108 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	CASK	O14936	926 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	CCL5	P13501	91 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ARHGDIA	P52565	204 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	HAND2	P61296	217 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	TFDP1	Q14186	410 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	PDK4	Q16654	411 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	DCST2	Q5T1A1	773 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	RLN3	Q8WXF3	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	MYLPF	Q96A32	169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	C18orf12	Q96KH6	178 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ERP44	Q9BS26	406 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	B9D1	Q9UPM9	204 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541		E9PQ18	207 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SDHD	O14521	159 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	RAMP1	O60894	148 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	KIAA0754	O94854	1291 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	MBD3	O95983	291 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	CHRNA1	P02708	482 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	BCKDHA	P12694	445 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	RPA2	P15927	270 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	DRD5	P21918	477 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ACADVL	P49748	655 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ARFIP1	P53367	373 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF85	Q03923	595 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	PAX8	Q06710	450 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	UBE2V2	Q15819	145 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	SENP8	Q96LD8	212 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RNF216-208	ENST00000479541	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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