RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-208ENST00000475959 ZNF264O43296 627 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 NTN1O95631 604 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 NUDT14O95848 222 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 IL2RAP01589 272 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 BCHEP06276 602 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ZCCHC18P0CG32 403 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 COX6B1P14854 86 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 PRKCAP17252 672 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 PGM1P36871 562 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SLC6A8P48029 635 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SQLEQ14534 574 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 PON3Q15166 354 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 HSPB2Q16082 182 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 VWA1Q6PCB0 445 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 MCEMP1Q8IX19 187 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 TRIML2Q8N7C3 387 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 FBXO27Q8NI29 283 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 FNDC9Q8TBE3 224 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 GPR119Q8TDV5 335 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ZBTB8AQ96BR9 441 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SPDL1Q96EA4 605 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 DTNBP1Q96EV8 351 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ITCHQ96J02 903 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 UCN2Q96RP3 112 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ACBD3Q9H3P7 528 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 IKZF5Q9H5V7 419 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 RMND5AQ9H871 391 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 COQ10BQ9H8M1 238 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CALHM2Q9HA72 323 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CHST11Q9NPF2 352 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 KCNJ16Q9NPI9 418 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 DSPPQ9NZW4 1301 aa10□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 A0A087WZY1 265 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 A0A0J9YW62 118 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SLC22A20A6NK97 555 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 AP3D1O14617 1153 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 TNFSF11O14788 317 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CXCL13O43927 109 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CYP7B1O75881 506 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 TNFSF13O75888 250 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 AQP8O94778 261 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ANP32DO95626 131 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CSTAP01040 98 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 KLK2P20151 261 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SFTPDP35247 375 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CRATP43155 626 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ASCL1P50553 236 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ATP4BP51164 291 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 HPCAP84074 193 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 QPRTQ15274 297 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 BCL2A1Q16548 175 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 AGKQ53H12 422 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 RETREG3Q86VR2 466 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 MEIOBQ8N635 442 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 OR5W2Q8NH69 310 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 OR10D3Q8NH80 312 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 STON2Q8WXE9 905 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 WNT2BQ93097 391 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 MAL2Q969L2 176 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 POLE3Q9NRF9 147 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 VAPAQ9P0L0 249 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ITPR2Q14571 2701 aa9.99□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 CENPEQ02224 2701 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 A0A096LPI6 279 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 A0A1W2PNV4 684 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 DVL2O14641 736 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 DNAJA2O60884 412 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 SOX30O94993 753 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 RCBTB2O95199 551 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 KRT75O95678 551 aa9.98□□□□□ -0.81
GTPBP1-208ENST00000475959 AGR2O95994 175 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms