RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 AGAP5A6NIR3 686 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 H0Y3Z8 333 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CLIC1O00299 241 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 EFNA2O43921 213 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GMFGO60234 142 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 NTN1O95631 604 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 IL18BPO95998 194 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CHRM4P08173 479 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 UBL4AP11441 157 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 BMP2P12643 396 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CAPN3P20807 821 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 DLX5P56178 289 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SKP2Q13309 424 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GTDC1Q4AE62 458 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GPAT3Q53EU6 434 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 AGKQ53H12 422 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 CGB2Q6NT52 195 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF524Q96C55 264 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 RUBCNLQ9H714 662 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 STOML1Q9UBI4 398 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-216ENST00000475195 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 A0A0G2JND7 137 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 H0YC42 278 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 ADAMDEC1O15204 470 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 CSTAP01040 98 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 ETFAP13804 333 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 CTSSP25774 331 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 KCNJ10P78508 379 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 GUCY1A3Q02108 690 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 PLAURQ03405 335 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 RGNQ15493 299 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 CMIPQ8IY22 773 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRG7Q96K78 797 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 RNF145Q96MT1 663 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 JKAMPQ9P055 326 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 MED12LQ86YW9 2145 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 H3BML4 177 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 SYT5O00445 386 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 NR5A2O00482 541 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 DVL2O14641 736 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 TGM6O95932 706 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 PRKCAP17252 672 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 ELK4P28324 431 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 OPRM1P35372 400 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 CRATP43155 626 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 DSTNP60981 165 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 FADDQ13158 208 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 CBFBQ13951 182 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 DPP10Q8N608 796 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF614Q8N883 585 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO27Q8NI29 283 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-216ENST00000475195 VAPAQ9P0L0 249 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms