RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 FETUBQ9UGM5 382 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PCYOX1Q9UHG3 505 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8OA6NCC3 632 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8NF8WBI6 632 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8RI6L899 631 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 M0R1B8 84 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CLGNO14967 610 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 BUD23O43709 281 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR137BO60478 399 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 DOK2O60496 412 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP11B1P15538 503 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PTAFRP25105 342 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMA3P25788 255 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP6V1E1P36543 226 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 THBS3P49746 956 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TPTEP56180 551 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 VAMP2P63027 116 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 BECN1Q14457 450 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 LIN54Q6MZP7 749 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ADCK2Q7Z695 626 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 MSANTD4Q8NCY6 345 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF398Q8TD17 642 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 STYXQ8WUJ0 223 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 DYRK2Q92630 601 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ITCHQ96J02 903 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRG7Q96K78 797 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 LYZL4Q96KX0 146 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 RUNDC3BQ96NL0 473 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 SMOXQ9NWM0 555 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT87PA6NCN2 255 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 HMX3A6NHT5 357 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 KLF11O14901 512 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC14L5O43304 696 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CHST10O43529 356 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 LYZL6O75951 148 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 AQP8O94778 261 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFRSF6BO95407 300 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 HSPA4LO95757 839 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAP00813 363 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPN3P26045 913 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CHATP28329 748 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 HMGCLP35914 325 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PPOXP50336 477 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 LCN2P80188 198 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 CUL4BQ13620 913 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS6KA1Q15418 735 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PIGGQ5H8A4 983 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 C10orf25Q5T742 122 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms