RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RND1	Q92730	232 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	IFT52	Q9Y366	437 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FAAH	O00519	579 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FBP2	O00757	339 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNHIT1	O43257	154 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZG16	O60844	167 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ARAF	P10398	606 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ETS2	P15036	469 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	IL7R	P16871	459 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PGC	P20142	388 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN18	P56856	261 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RBBP4	Q09028	425 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MAPK14	Q16539	360 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DCST1	Q5T197	706 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CBLN3	Q6UW01	205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ASB5	Q8WWX0	329 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM19	Q96HH6	336 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241		H0Y3Z8	333 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MRAS	O14807	208 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT14	O95848	222 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CD1E	P15812	388 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ME2	P23368	584 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A2	P23975	617 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RAC1	P63000	192 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ART3	Q13508	389 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GJE1	A6NN92	205 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PGM3	O95394	542 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NTN1	O95631	604 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GLI4	P10075	376 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	UQCRB	P14927	111 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PRDX6	P30041	224 aa		13.21	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms