RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 MKS1Q9NXB0 559 aa7□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 KLHL13Q9P2N7 655 aa7□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 GRID1Q9ULK0 1009 aa7□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 USH1CQ9Y6N9 552 aa7□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TNFSF11O14788 317 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TYROBPO43914 113 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 EFNA2O43921 213 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 SSX4O60224 188 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 DLX3O60479 287 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 RAMP1O60894 148 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ULK1O75385 1050 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 OR4F21O95013 312 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 PGM3O95394 542 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ADAP00813 363 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 KRT6AP02538 564 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 KRT6BP04259 564 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 YES1P07947 543 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 LINGO3P0C6S8 592 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 PYGBP11216 843 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 CREB1P16220 341 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TAC1P20366 129 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 KRT6CP48668 564 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 RASSF2P50749 326 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 CASP9P55211 416 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 CDH13P55290 713 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 SLC18A2Q05940 514 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TSC22D1Q15714 1073 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 AGAP6Q5VW22 663 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ATG16L1Q676U5 607 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 Q6ZT83 130 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 MISPQ8IVT2 679 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ABHD3Q8WU67 409 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 PROX1Q92786 737 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 APIPQ96GX9 242 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 KLHL15Q96M94 604 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 RNF145Q96MT1 663 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 BBS4Q96RK4 519 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF382Q96SR6 550 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ALG2Q9H553 416 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 C12orf49Q9H741 205 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 BCO1Q9HAY6 547 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TIGARQ9NQ88 270 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 NTMQ9P121 344 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 VDAC3Q9Y277 283 aa6.99□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PQD3 144 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 A8MT66 165 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 H7C417 338 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 RGS14O43566 566 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 NDUFB5O43674 189 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 LMX1BO60663 402 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 PRKD3O94806 890 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 NKX2-2O95096 273 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 KCNH1O95259 989 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 NTN1O95631 604 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 OPN1LWP04000 364 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TSPAN8P19075 237 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 COX5AP20674 150 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ME2P23368 584 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 ELK4P28324 431 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 TTKP33981 857 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 GABRA3P34903 492 aa6.98□□□□□ -1.29
LINC00578-201ENST00000439009 OR3A2P47893 321 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms