RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HOXC5Q00444 222 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VASNQ6EMK4 673 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GGNQ86UU5 652 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXO27Q8NI29 283 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SARAFQ96BY9 339 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AKAP9Q99996 3911 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITPR2Q14571 2701 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AKAP6Q13023 2319 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A0G2JNJ9 132 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR14I1A6ND48 311 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DUXAA6NLW8 204 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLCA1A8K7I4 914 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H0Y3Z8 333 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCKDKO14874 412 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF264O43296 627 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUDT14O95848 222 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGR2O95994 175 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GKN3PP0CG01 181 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COX4I1P13073 169 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF708P17019 499 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKCAP17252 672 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTNP21246 168 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACVR2AP27037 513 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RYKP34925 604 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRYBA2P53672 197 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FADDQ13158 208 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCARB2Q14108 478 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 QPRTQ15274 297 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WLSQ5T9L3 541 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF527Q8NB42 609 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR119Q8TDV5 335 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIB1Q96RU8 372 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POLE3Q9NRF9 147 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q9UFV3 132 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF6Q9Y252 685 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WIPF3A6NGB9 483 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 E9PLN8 166 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TPST1O60507 370 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NTN1O95631 604 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TGM6O95932 706 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NID1P14543 1247 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF17P17021 662 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPX2P18283 190 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SFTPDP35247 375 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC6A8P48029 635 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 P2RX1P51575 399 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRISP3P54108 245 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDK6Q00534 326 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PMPCAQ10713 525 aa8.48□□□□□ -1.05
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms