RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 PGM1P36871 562 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CLDN15P56746 228 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CLDN20P56880 219 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 FOXF1Q12946 379 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 SKP2Q13309 424 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CBFBQ13951 182 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 PLXDC2Q6UX71 529 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 LIX1LQ8IVB5 337 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 C9orf106Q8NAJ2 232 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 GPR119Q8TDV5 335 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ARSGQ96EG1 525 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CHST11Q9NPF2 352 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 NKX2-6A6NCS4 301 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TMEM247A6NEH6 219 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 AGAP5A6NIR3 686 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CLDN24A6NM45 220 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 C19orf84I3L1E1 186 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ANGPT2O15123 496 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 NUDT7P0C024 238 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CRISP3P54108 245 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 KCNJ10P78508 379 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 FADDQ13158 208 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ZNF787Q6DD87 383 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 FBXO27Q8NI29 283 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TSPEARQ8WU66 669 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 SLC38A5Q8WUX1 472 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 UCN2Q96RP3 112 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CALML5Q9NZT1 146 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 CLCF1Q9UBD9 225 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 STOML1Q9UBI4 398 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 MED12Q93074 2177 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 OPN1LWP04000 364 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 PRKCAP17252 672 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 RAC1P63000 192 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 GNA13Q14344 377 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 QPRTQ15274 297 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 GGNQ86UU5 652 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 RETREG3Q86VR2 466 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 PMM1Q92871 262 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 WNT2BQ93097 391 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ZNF524Q96C55 264 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TMEM19Q96HH6 336 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TM9SF2Q99805 663 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 PINK1Q9BXM7 581 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 MRGBPQ9NV56 204 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 DVL2O14641 736 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 DNAJA2O60884 412 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 TGM6O95932 706 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 DBIP07108 87 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 BMP2P12643 396 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 IL7RP16871 459 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 IL11P20809 199 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ME2P23368 584 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ADH6P28332 368 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ZNF136P52737 540 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 P4HA3Q7Z4N8 544 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 DPP10Q8N608 796 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 C10orf82Q8WW14 230 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 MAL2Q969L2 176 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-205ENST00000426683 MRGPRX4Q96LA9 322 aa16.23■□□□□ 0.19
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