RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ZNF227Q86WZ6 799 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SLC7A13Q8TCU3 470 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SH2D2AQ9NP31 389 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 HPF1Q9NWY4 346 aa21.27■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 FPR1P21462 350 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CCR4P51679 360 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 FGD3Q5JSP0 725 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 GDF7Q7Z4P5 450 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 FUZQ9BT04 418 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 C9orf16Q9BUW7 83 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 METTL7AQ9H8H3 244 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 KLRF1Q9NZS2 232 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ICAM5Q9UMF0 924 aa21.26■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 LYPD3O95274 346 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 LINC00696Q6ZRV3 163 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ZNF550Q7Z398 422 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SLC35B4Q969S0 331 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SLC41A3Q96GZ6 507 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ALPK1Q96QP1 1244 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 LAT2Q9GZY6 243 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PROK2Q9HC23 129 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 IGF2RP11717 2491 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 EML6Q6ZMW3 1958 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PRQ8 180 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PEX1O43933 1283 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 FMO6PO60774 539 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 RASAL1O95294 804 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PTNP21246 168 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 AQP4P55087 323 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 DGCR6Q14129 220 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 DEFB109BQ30KR1 87 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 IZUMO2Q6UXV1 221 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SVOPLQ8N434 492 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ZNF559Q9BR84 538 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SLC7A7Q9UM01 511 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 POLHQ9Y253 713 aa21.25■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CACNA1AO00555 2505 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 G3V3Y1 287 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 TP53I11O14683 189 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 WISP1O95388 367 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ADRB1P08588 477 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 LINGO3P0C6S8 592 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 MST1P26927 711 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 RRADP55042 308 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ABHD17BQ5VST6 288 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 WDR88Q6ZMY6 472 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CADM2Q8N3J6 435 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PAQR8Q8TEZ7 354 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 DPH1Q9BZG8 443 aa21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GWA3 101 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 C7orf72A4D263 438 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 OR5F1O95221 314 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 HLCSP50747 726 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SOX8P57073 446 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 KCNAB2Q13303 367 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 MICAQ29983 383 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PODNL1Q6PEZ8 512 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 LSMEM1Q8N8F7 131 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PRSS27Q9BQR3 290 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 BATF3Q9NR55 127 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 GPR83Q9NYM4 423 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 PLA2G3Q9NZ20 509 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 SSUH2Q9Y2M2 353 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 URB1O60287 2271 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 DLGAP1O14490 977 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CD96P40200 585 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 CCL11P51671 97 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ZNF440Q8IYI8 595 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 EVA1AQ9H8M9 152 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 MED11Q9P086 117 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 LRRC42Q9Y546 428 aa21.23■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 A0A0B4J2E0 115 aa21.22■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GX12 115 aa21.22■□□□□ 0.99
CNN3-202ENST00000394202 ALPLP05186 524 aa21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms