RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR119Q8TDV5 335 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 INPP5KQ9BT40 448 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SAP130Q9H0E3 1048 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 POLE3Q9NRF9 147 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ZIM2Q9NZV7 527 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCA4P78363 2273 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TUBAL3A6NHL2 446 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CTAG2O75638 210 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC22A3O75751 556 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 NUDT14O95848 222 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 C1QCP02747 245 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 IL6P05231 212 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 UBL4AP11441 157 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ME2P23368 584 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ELK4P28324 431 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CDKN2CP42773 168 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CPA2P48052 419 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 KHKP50053 298 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FUT5Q11128 374 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXF1Q12946 379 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP6Q13023 2319 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GUSBP1Q15486 140 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFAF6Q330K2 333 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 VWA1Q6PCB0 445 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 EPGNQ6UW88 154 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 HDXQ7Z353 690 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM200AQ86VY9 491 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 OR5W2Q8NH69 310 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 OR10D3Q8NH80 312 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC8CQ8TDW0 803 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ROPN1LQ96C74 230 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ARSGQ96EG1 525 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 MARK4Q96L34 752 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 GALNT8Q9NY28 637 aa18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0J9YW62 118 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 HMGN4O00479 90 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 UBDO15205 165 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0513O60268 411 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 DIAPH2O60879 1101 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 AQP8O94778 261 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 OPN1LWP04000 364 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FCGR2AP12318 317 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 IL11P20809 199 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 BTLAQ7Z6A9 289 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF130Q86XS8 419 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 LILRA2Q8N149 483 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2V1Q8NHB1 315 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO27Q8NI29 283 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 LAT2Q9GZY6 243 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 VIPAS39Q9H9C1 493 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR45Q9Y484 360 aa18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFSF11O14788 317 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 EFNA2O43921 213 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJA2O60884 412 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TGDSO95455 350 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 NTN1O95631 604 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 EPXP11678 715 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKCAP17252 672 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 PCYT1AP49585 367 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SKP2Q13309 424 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CBFBQ13951 182 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FGFBP1Q14512 234 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 MAPK14Q16539 360 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 FRRS1Q6ZNA5 592 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CDH24Q86UP0 819 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF619Q8N2I2 560 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 RFWD2Q8NHY2 731 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC01560Q8TB33 94 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF524Q96C55 264 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHL15Q96M94 604 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 A6NNC1 897 aa18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 RFXANKO14593 260 aa18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 CXCL13O43927 109 aa18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3-201ENST00000392415 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms