RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 BCL9O00512 1426 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 NCOA1Q15788 1441 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 KIF27Q86VH2 1401 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CLTCL1P53675 1640 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 GSAPA4D1B5 854 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 FRG2CA6NGY1 282 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SAGE2PA6NJ88 616 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PPIAL4DF5H284 164 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 M0QX08 132 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 GPAA1O43292 621 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 LATO43561 262 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CYTH3O43739 400 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 TBX19O60806 448 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 NEBLO76041 1014 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 B3GAT3O94766 335 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA0754O94854 1291 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 IGF1P05019 195 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CD55P08174 381 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SLC35E2P0CK97 266 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PDHBP11177 359 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PGAM2P15259 253 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 IGHV1-2P23083 117 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.36□□□□□ -2.031e-6■■■■□ 23
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PTPRC-205ENST00000391970 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CA8P35219 290 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEA5P43359 124 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 XCR1P46094 333 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 BDKRB1P46663 353 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A1P53007 311 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CNTN2Q02246 1040 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF154Q13106 437 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 TGIF1Q15583 401 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SLC1A5Q15758 541 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 TEX44Q53QW1 395 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 USP16Q9Y5T5 823 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ABCC2Q92887 1545 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ELP1O95163 1332 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 SHANK2Q9UPX8 1470 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1B0GUA9 196 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 A8MUI8 341 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 TBXA2RP21731 343 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 FASP25445 335 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 TPSAB1Q15661 275 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PDK4Q16654 411 aa2.35□□□□□ -2.03
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