RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CPNE6O95741 557 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 LPAL2Q16609 132 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 LSMEM2Q8N112 164 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ARL14Q8N4G2 192 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD9Q8NBP5 474 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T35Q8NGX2 323 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NDNFQ8TB73 568 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ERVFC1P60507 584 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA3BQ13214 749 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NR0B2Q15466 257 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 UBTD2Q8WUN7 234 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 HMX3A6NHT5 357 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RAB3DO95716 219 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 AIFM1O95831 613 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RGS6P49758 472 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PPA1Q15181 289 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PGM2L1Q6PCE3 622 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 IGFN1Q86VF2 1251 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 VRK2Q86Y07 508 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF595Q8IYB9 648 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 DNAAF1Q8NEP3 725 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM163Q8TC26 289 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ITPKCQ96DU7 683 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM68Q96MH6 324 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM168Q9H0V1 697 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 BABAM2Q9NXR7 383 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JMP0 313 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CRHBPP24387 322 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR4M2Q8NGB6 313 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL13Q9P2N7 655 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 HHLA2Q9UM44 414 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CDK2P24941 298 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR1Q1Q15612 314 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF691Q5VV52 312 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R3BQ86XI6 285 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CSNK1A1P48729 337 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A13Q8TCU3 470 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 REV1Q9UBZ9 1251 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CHD4Q14839 1912 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 GFRA2O00451 464 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SC5DO75845 299 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CST9Q5W186 159 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ARRDC3Q96B67 414 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TCTN2Q96GX1 697 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS16Q9NQE7 514 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A14Q9UN76 642 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TVP23AA6NH52 213 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 HHLA1C9JL84 531 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINA5P05154 406 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RAB3AP20336 220 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 METTL11BQ5VVY1 283 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OPN5Q6U736 354 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ACAD8Q9UKU7 415 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR7A17O14581 309 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CACNG3O60359 315 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A7O60669 478 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 UPK1BO75841 260 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 GPR50Q13585 617 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR51T1Q8NGJ9 327 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 IFNA1P01562 189 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZSR9 355 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R35Q8TAP8 253 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RAD1O60671 282 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT7P0C024 238 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MMP12P39900 470 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNEQ04844 493 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN31Q12999 210 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SELPLGQ14242 412 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PDZD9Q8IXQ8 264 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms