RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356162.5

CNOT4-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 2,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-202ENST00000356162 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.833e-6■■■■□ 24
CNOT4-202ENST00000356162 GPR68Q15743 365 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 CD226Q15762 336 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 C3AR1Q16581 482 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 EIPR1Q53HC9 387 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 WLSQ5T9L3 541 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 FDX2Q6P4F2 183 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 AAGABQ6PD74 315 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 APOOLQ6UXV4 268 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ARPINQ7Z6K5 226 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 IFNEQ86WN2 208 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 FAM26EQ8N5C1 309 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 GATSQ8NAP1 163 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 OR8J3Q8NGG0 315 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 OR4C3Q8NH37 302 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ARSGQ96EG1 525 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM19Q96HH6 336 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 SFXN2Q96NB2 322 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PRDM14Q9GZV8 571 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 LAT2Q9GZY6 243 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 FAM107BQ9H098 131 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 GID8Q9NWU2 228 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 VAPAQ9P0L0 249 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 HIF3AQ9Y2N7 669 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 SPTA1P02549 2419 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 NINQ8N4C6 2090 aa3.6□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ATMQ13315 3056 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 A0A096LPE4 126 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 A0A0G2JPF8 293 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 A0A1W2PPZ6 126 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 AGAP5A6NIR3 686 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 B4DXG7 233 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 C5orf58C9J3I9 102 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 E9PLN8 166 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 FXYD1O00168 92 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 UGT2B17O75795 530 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TRAPPC6AO75865 159 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 DCTN3O75935 186 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 C1QCP02747 245 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TPOP07202 933 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 COX4I1P13073 169 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 GPX2P18283 190 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PCGF2P35227 344 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 SLC6A8P48029 635 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 P2RX1P51575 399 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 GFRA1P56159 465 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 DLX5P56178 289 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 CHRNEQ04844 493 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 RBBP4Q09028 425 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 SKP2Q13309 424 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 CBFBQ13951 182 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TOMM20Q15388 145 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 MAPK11Q15759 364 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 SYPL1Q16563 259 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 MMEL1Q495T6 779 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 RNF220Q5VTB9 566 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ENPP6Q6UWR7 440 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 RPTNQ6XPR3 784 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa3.59□□□□□ -1.83
CNOT4-202ENST00000356162 PEX5LQ8IYB4 626 aa3.59□□□□□ -1.83
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