RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294613.9

TM2D1-201, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D1, Length 1,250 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-201ENST00000294613 MKLN1Q9UL63 735 aa15.49■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.49■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ITPR3Q14573 2671 aa15.49■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 VPS13CQ709C8 3753 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 A0A0J9YW62 118 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 TNFSF11O14788 317 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ADAMDEC1O15204 470 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 EFNA2O43921 213 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 UGT2B17O75795 530 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 NTN1O95631 604 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CRHP06850 196 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PRKCAP17252 672 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CAPN3P20807 821 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ELK4P28324 431 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CPA2P48052 419 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 P2RX1P51575 399 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 GPR68Q15743 365 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 NXNQ6DKJ4 435 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 OR2A2Q6IF42 318 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 BTLAQ7Z6A9 289 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 RNF130Q86XS8 419 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 LRRC46Q96FV0 321 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PIGMQ9H3S5 423 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 COQ10BQ9H8M1 238 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PCDHGB4Q9UN71 923 aa15.48■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SERINC4A6NH21 518 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 DUXAA6NLW8 204 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 A6NNC1 897 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 A8MXE2 369 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 HMGN4O00479 90 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CXCL13O43927 109 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 STX11O75558 287 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SOX30O94993 753 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CGAP01215 116 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 GSNP06396 782 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 FCGR2AP12318 317 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 IDO1P14902 403 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PEX19P40855 299 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CCR4P51679 360 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 RAC1P63000 192 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 COX20Q5RI15 118 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 FBXO27Q8NI29 283 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 LINC01560Q8TB33 94 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 GPR119Q8TDV5 335 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 FAM222BQ8WU58 562 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ROPN1LQ96C74 230 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 KLHL15Q96M94 604 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 C7orf26Q96N11 449 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 OR52E6Q96RD3 313 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.47■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CCDC154A6NI56 674 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 MSTNO14793 375 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF264O43296 627 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 DIAPH2O60879 1101 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 DNAJA2O60884 412 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 NUDT14O95848 222 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SFTPDP35247 375 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 TESK1Q15569 626 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 KIF18BQ86Y91 864 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 PANX1Q96RD7 426 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 RASSF1Q9NS23 344 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 EXD2Q9NVH0 621 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 WDR45Q9Y484 360 aa15.46■□□□□ 0.07
TM2D1-201ENST00000294613 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms