RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276654.9

LRP12-201, Transcript of LDL receptor related protein 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP12, Length 4,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12-201ENST00000276654 MAGEA8P43361 318 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 LIMS1P48059 325 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 Q6ZT83 130 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ZFP90Q8TF47 636 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 RAB8BQ92930 207 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 OVOL3O00110 214 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 OR4F21O95013 312 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ATP1B1P05026 303 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 EPORP19235 508 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 UCN2Q96RP3 112 aa6.85□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 H0YIV9 168 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CDC14BO60729 498 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ALX3O95076 343 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 C2P06681 752 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 PHBP35232 272 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 SERPINB4P48594 390 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 GALK2Q01415 458 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 FOXF1Q12946 379 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 TMEM225Q6GV28 225 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 SNX33Q8WV41 574 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CRLF2Q9HC73 371 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ZNF195O14628 629 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 SEC22BO75396 215 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CGAP01215 116 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 EGR1P18146 543 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 STX2P32856 288 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 RBBP8Q99708 897 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 PLK3Q9H4B4 646 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 OR4A8P0C604 315 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CT45A8P0DMV1 189 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CT45A9P0DMV2 189 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 GGT5P36269 586 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 PRR5P85299 388 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 SLC29A2Q14542 456 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 ADRM1Q16186 407 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 FBF1Q8TES7 1133 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 PPCDCQ96CD2 204 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.84□□□□□ -1.31
LRP12-201ENST00000276654 MAGEA6P43360 314 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 CCNJQ5T5M9 372 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 METTL4Q8N3J2 472 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 OR7G2Q8NG99 324 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 TMEM160Q9NX00 188 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 UGDHO60701 494 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 PDYNP01213 254 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 SPOCK1Q08629 439 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 GPR68Q15743 365 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 ISCA2Q86U28 154 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.83□□□□□ -1.32
LRP12-201ENST00000276654 ELOA3Q8NG57 546 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms