RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.18■□□□□ 0.02
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CTCF-201ENST00000264010 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.18■□□□□ 0.02
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CTCF-201ENST00000264010 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.17■□□□□ 0.02
CTCF-201ENST00000264010 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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CTCF-201ENST00000264010 ZNF559Q9BR84 538 aa15.17■□□□□ 0.02
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CTCF-201ENST00000264010 CEP290O15078 2479 aa15.16■□□□□ 0.02
CTCF-201ENST00000264010 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.16■□□□□ 0.02
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CTCF-201ENST00000264010 ITGA3P26006 1051 aa15.16■□□□□ 0.02
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CTCF-201ENST00000264010 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
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CTCF-201ENST00000264010 LMX1AQ8TE12 382 aa15.16■□□□□ 0.02
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