RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh4P39038 913 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UbqlnlQ14DL0 610 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C130050O18RikQ497Y9 356 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grhl3Q5FWH3 603 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc43a2Q8CGA3 568 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il17rdQ8JZL1 738 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MepceQ8K3A9 666 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr658Q8VGV5 323 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl43Q99N89 183 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NepnQ9CQ76 512 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BlvraQ9CY64 295 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CcniQ9Z2V9 377 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrk1Q3UHC2 2014 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm28576A0A087WRP6 222 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1206A2ATJ9 307 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl3E0CZ16 587 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr723E9PZU2 309 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr724K7N5X7 309 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3476K7N6V0 257 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alox5P48999 674 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Copz1P61924 177 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Polr2cP97760 275 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HbegfQ06186 208 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CrhbpQ60571 322 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcap31Q61335 245 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ldoc1Q7TPY9 151 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tas2r40Q7TQB8 319 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kansl1Q80TG1 1036 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slitrk4Q810B8 837 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a40Q8BGP6 337 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrp11Q8CB67 483 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eipr1Q8K0G5 386 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Med9Q8VCS6 142 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1232Q8VEX7 311 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr450Q8VF81 310 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UgdhO70475 493 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fcgr3P08508 261 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Srp54P14576 504 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LhcgrP30730 700 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps25P62852 125 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcst1Q059Y8 732 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MlanaQ2TA50 113 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itpripl2Q3UV16 535 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klri2Q5DT36 248 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serinc4Q5XK03 492 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc6a5Q761V0 799 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt6Q8CH40 313 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alkbh3Q8K1E6 286 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lsm14aQ8K2F8 462 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BollQ924M5 281 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NtmQ99PJ0 344 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Med18Q9CZ82 208 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccl27Q9Z1X0 120 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RfxankQ9Z205 269 aa19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rai1Q61818 1889 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamts20P59511 1906 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col4a4Q9QZR9 1682 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp978A2A7I1 335 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17067E9Q6S4 354 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp870J3QMA4 560 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gabrg2P22723 474 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hsd3b2P26149 373 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Commd6Q3V4B5 87 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xkr7Q5GH64 580 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc30a1Q60738 503 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AardQ811W1 167 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp101Q8BP18 612 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Frs3Q91WJ0 492 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nfkb2Q9WTK5 899 aa19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IghdA0A0A6YW14 291 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8127E9Q0P0 100 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8094K7N6U8 211 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tspan6O70401 245 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk1P15947 261 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc1a3P56564 543 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cxcl3Q6W5C0 100 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr699Q7TRN3 316 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abhd16bQ80YU0 474 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc26a11Q80ZD3 593 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrg7Q8BM96 785 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp119bQ8K0G9 543 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FlcnQ8QZS3 579 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DhrsxQ8VBZ0 335 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tssk6Q925K9 273 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sucnr1Q99MT6 317 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem53Q9D0Z3 276 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpn2Q9DBB9 547 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MeltfQ9R0R1 738 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sac3d1A6H687 427 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp40B1B1D3 796 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8882E9Q7E4 283 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17555F6U8B9 371 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcsk2P21661 637 aa19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FahP35505 419 aa19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.1 ms