RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CTNSO60931 367 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ETFAP13804 333 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 FASP25445 335 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 DSTNP60981 165 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNB3Q05901 458 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MORN4Q8NDC4 146 aa22.01■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 PYURFQ96I23 114 aa22.01■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF1Q9NS23 344 aa22.01■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WV62 115 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX30O94993 753 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNA14P01570 189 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35E2P0CK97 266 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SESN3P58005 492 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF4P78317 190 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK6Q00534 326 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf185Q5T7R7 199 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM180BQ6P0A1 224 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CBLL1Q75N03 491 aa22■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 ANKFN1Q8N957 763 aa22■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 LYPD8Q6UX82 237 aa21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR2L13Q8N349 312 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf4Q9NR00 106 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CRIM1Q9NZV1 1036 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YJX3 145 aa21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR8D2Q9GZM6 311 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 PROK2Q9HC23 129 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SACM1LQ9NTJ5 587 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 MAN2A2P49641 1150 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC10A1Q14973 349 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35G5Q96KT7 338 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAD8Q9UKU7 415 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM247A6NEH6 219 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 DUXAA6NLW8 204 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGN4O00479 90 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 HCN1O60741 890 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 LDB3O75112 727 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS23O95084 383 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MATN1P21941 496 aa21.97■■□□□ 1.11
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