RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF550Q7Z398 422 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRSXQ8N5I4 330 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF559Q9BR84 538 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF17Q9P2E2 1029 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 EXPH5Q8NEV8 1989 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRAM2Q15035 370 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1Q1Q15612 314 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 PODNL1Q6PEZ8 512 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 LYPD8Q6UX82 237 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MBOAT4Q96T53 435 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TOR3AQ9H497 397 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 ALG1L2C9J202 215 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FADS1O60427 444 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MITFO75030 526 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2J2O76002 312 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ICAM2P13598 275 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CBLP22681 906 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.83■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC15A4Q8N697 577 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A8Q8TCC7 542 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT84Q9NSB2 600 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YAE9 185 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BNH8 94 aa22.82■■□□□ 1.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 UBL4AP11441 157 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPGP40121 348 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MRGPREQ86SM8 312 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00471Q8N535 108 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 IL22RA1Q8N6P7 574 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GATSQ8NAP1 163 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CYGBQ8WWM9 190 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 HGDQ93099 445 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC38A4Q969I6 547 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RASL10BQ96S79 203 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.82■■□□□ 1.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF264O43296 627 aa22.82■■□□□ 1.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 EVI2BP34910 448 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXW4P57775 412 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNAB2Q13303 367 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SKP2Q13309 424 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF613Q6PF04 617 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP54Q7Z3B4 507 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB43Q86YS6 212 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP11Q8NBQ7 271 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ARSGQ96EG1 525 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM2Q9C040 744 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM118AQ9NWS6 357 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 IL17BQ9UHF5 180 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.82■■□□□ 1.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WUU8 490 aa22.81■■□□□ 1.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR10H3O60404 316 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO45P0C2W1 286 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 Q0VFX4 171 aa22.81■■□□□ 1.24
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CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH3Q86UD3 253 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NKAIN4Q8IVV8 208 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF138Q8WVD3 245 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC9Q92623 222 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CNBD2Q96M20 576 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NODALQ96S42 347 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS27Q9BQR3 290 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 MASP2O00187 686 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM10O14672 748 aa22.8■■□□□ 1.24
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