RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL15Q96M94 604 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5B2Q96R09 309 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 POLE3Q9NRF9 147 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ATG4BQ9Y4P1 393 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPNS1P04632 268 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 S100A10P60903 97 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 HERV-K104P61576 105 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5M10Q6IEU7 315 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRED1Q7Z699 444 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF595Q8IYB9 648 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 POTEKPQ9BYX7 375 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GFYI3L273 518 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GPX2P18283 190 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TPMTP51580 245 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB38P57729 211 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ABHD17CQ6PCB6 329 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R3BQ86XI6 285 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 OLIG1Q8TAK6 271 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CREB3L1Q96BA8 519 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 B3GALT4O96024 378 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PGGHGQ32M88 737 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ART1P52961 327 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 HSD11B2P80365 405 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 NTRK2Q16620 822 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPPEQ6ZT21 453 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 AMDHD1Q96NU7 426 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GSKIPQ9P0R6 139 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCD2Q9UBJ2 740 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXL3Q9UKT7 428 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TFAP2AP05549 437 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FOLR3P41439 243 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5W2Q8NH69 310 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GASTP01350 101 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CA5AP35218 305 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 POU3F4P49335 361 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 DAPP51397 102 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 NKX3-2P78367 333 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SRYQ05066 204 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SH2D5Q6ZV89 423 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ELSPBP1Q96BH3 223 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CACNG6Q9BXT2 260 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CARD8Q9Y2G2 431 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PLPP1O14494 284 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO45P0C2W1 286 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CRABP1P29762 137 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 BCL6P41182 706 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ADPRHP54922 357 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF91Q05481 1191 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CBFBQ13951 182 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 EFR3AQ14156 821 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 HES5Q5TA89 166 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 Q6ZNB5 142 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 RABEPKQ7Z6M1 372 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TVP23AA6NH52 213 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM227AF5H4B4 570 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 H0Y8X5 98 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD1O60671 282 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 APOC1P02654 83 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM71E1Q6IPT2 247 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GGHQ92820 318 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 NEURL3Q96EH8 262 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K3Q99759 626 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 NLKQ9UBE8 527 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS6P49758 472 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SFXN2Q96NB2 322 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 EGLN3Q9H6Z9 239 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 LCN1P31025 176 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC32Q9BV29 185 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CEPT1Q9Y6K0 416 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 POM121BA6NF01 834 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SCGNO76038 276 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ITGB8P26012 769 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 OR7A5Q15622 319 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF750Q32MQ0 723 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 BCL2L15Q5TBC7 163 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GLO1Q04760 184 aa19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms