RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	MED17	Q9NVC6	651 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	GALNT8	Q9NY28	637 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	HAO1	Q9UJM8	370 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A1W2PNV4	684 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989		A8MXE2	369 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989		H3BNH8	94 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTAG2	O75638	210 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNFSF13	O75888	250 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	SOX30	O94993	753 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	S100A3	P33764	101 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP12A	P54707	1039 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF117	Q03924	483 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR68	Q15743	365 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	SDF2	Q99470	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR51I1	Q9H343	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	THAP1	Q9NVV9	213 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989		A6NNC1	897 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989		C9JVG2	144 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	SDHD	O14521	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNFSF11	O14788	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	OIP5	O43482	229 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP7B1	O75881	506 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	EPX	P11678	715 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF17	P17021	662 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	UQCRC2	P22695	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ME2	P23368	584 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	EPHA3	P29320	983 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNJ5	P48544	419 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	P2RX1	P51575	399 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCR4	P51679	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	UFM1	P61960	85 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	PHC1	P78364	1004 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	KLHL26	Q53HC5	615 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	GGN	Q86UU5	652 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAB8B	Q92930	207 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	STARD4	Q96DR4	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	RASSF1	Q9NS23	344 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	EXD2	Q9NVH0	621 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABCA4	P78363	2273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989		E9PBE3	544 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	MSTN	O14793	375 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CASK	O14936	926 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKRD28	O15084	1053 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	HDAC3	O15379	428 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CXCL13	O43927	109 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCN2B	O60939	215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	AQP8	O94778	261 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYNGR4	O95473	234 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	CRH	P06850	196 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63

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