RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580948.1

LINC00511-211, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 3

Gene LINC00511, Length 475 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-211ENST00000580948 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 WDR1O75083 606 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 UGT2B17O75795 530 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 H6PDO95479 791 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ACTL6AO96019 429 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CHRM4P08173 479 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ETFAP13804 333 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CPN1P15169 458 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 HPGDP15428 266 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CHMP24386 653 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 LHX2P50458 406 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ART1P52961 327 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 NUP107P57740 925 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF117Q03924 483 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SYPL1Q16563 259 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 IFNEQ86WN2 208 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MISPQ8IVT2 679 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 EID3Q8N140 333 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ANKFN1Q8N957 763 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF527Q8NB42 609 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 C10orf82Q8WW14 230 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF524Q96C55 264 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZG16BQ96DA0 208 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 NPAS1Q99742 590 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 HHATLQ9HCP6 504 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 WDR45Q9Y484 360 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GMEB1Q9Y692 573 aa8.36□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DNHD1Q96M86 4753 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OR2M5A3KFT3 312 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SERINC4A6NH21 518 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 HCRTR2O43614 444 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GMFGO60234 142 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ANP32DO95626 131 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GLI4P10075 376 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GABRA1P14867 456 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF708P17019 499 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 HK1P19367 917 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MSX1P28360 303 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ADH7P40394 386 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 STARP49675 285 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ARFIP2P53365 341 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CLDN15P56746 228 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CLDN18P56856 261 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PLAURQ03405 335 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CHRNEQ04844 493 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PMPCAQ10713 525 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SKP2Q13309 424 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RGNQ15493 299 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GPR68Q15743 365 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RAET1LQ5VY80 246 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CBLN3Q6UW01 205 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 RETREG3Q86VR2 466 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 C10orf111Q8N326 155 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 DPP10Q8N608 796 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TSPEARQ8WU66 669 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SFXN2Q96NB2 322 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 SAR1AQ9NR31 198 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 MED17Q9NVC6 651 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 VAPAQ9P0L0 249 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 LIPT1Q9Y234 373 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.35□□□□□ -1.07
LINC00511-211ENST00000580948 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms