RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SSTR2P30874 369 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 STARD5Q9NSY2 213 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CYCSP99999 105 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CBLL1Q75N03 491 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 LILRB2Q8N423 598 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 RNF186Q9NXI6 227 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 MPIG6BO95866 241 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 RAC2P15153 192 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CRHBPP24387 322 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 PTGER1P34995 402 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 P2RY14Q15391 338 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 C4orf36Q96KX1 117 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 IL37Q9NZH6 218 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CTSAP10619 480 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 RAB3AP20336 220 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 PODNL1Q6PEZ8 512 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 NT5C3BQ969T7 300 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SPTSSAQ969W0 71 aa20.07■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 GJB3O75712 270 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 BDKRB2P30411 391 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC6A8P48029 635 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 MYADMQ96S97 322 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 APOOQ9BUR5 198 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 A8MVJ9 347 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 CTHP32929 405 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CD79BP40259 229 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 H3BML4 177 aa20.06■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 A6NIZ1 184 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 RAP1BP61224 184 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 RAP1AP62834 184 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 MRI1Q9BV20 369 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 GJE1A6NN92 205 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 MAN2B1O00754 1011 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CYBAP13498 195 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ITGB7P26010 798 aa20.05■□□□□ 0.8
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