RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A096LPI6	279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	C7orf72	A4D263	438 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	UGT2B17	O75795	530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	NR2F1	P10589	423 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CRAT	P43155	626 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	FUT5	Q11128	374 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SYPL1	Q16563	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TOX	O94900	526 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	H6PD	O95479	791 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CSTA	P01040	98 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	DSTN	P60981	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CHRNE	Q04844	493 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GTDC1	Q4AE62	458 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CBLN3	Q6UW01	205 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PMM1	Q92871	262 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	WNT2B	Q93097	391 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A1W2PP18	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CLIC1	O00299	241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	DVL2	O14641	736 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SEC14L5	O43304	696 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	OIP5	O43482	229 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CYP7B1	O75881	506 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ETFA	P13804	333 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CAPN3	P20807	821 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ME2	P23368	584 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CCR4	P51679	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ARFIP2	P53365	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms