RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563333.1

SNAP23-205, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene SNAP23, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-205ENST00000563333 ARPC3O15145 178 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MAGEB3O15480 346 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RAMP1O60894 148 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GPX5O75715 221 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 IGHV1-2P23083 117 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MMP11P24347 488 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 XCR1P46094 333 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 P2RY1P47900 373 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CASP4P49662 377 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RIPK4P57078 832 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 DSCR10P59022 87 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 VLDLRP98155 873 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 BDH1Q02338 343 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 C1orf61Q13536 156 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SERTAD2Q14140 314 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 KCNJ11Q14654 390 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TEX44Q53QW1 395 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR2L2Q8NH16 312 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 FBXO30Q8TB52 745 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 AGAP11Q8TF27 550 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PIGCQ92535 297 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SENP8Q96LD8 212 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 APOL2Q9BQE5 337 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 VPS33BQ9H267 617 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF221Q9UK13 617 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OARD1Q9Y530 152 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SPACA6W5XKT8 324 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CHD4Q14839 1912 aa3.4□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CXCL11O14625 94 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SURF6O75683 361 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CD55P08174 381 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PGAM2P15259 253 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PGCP20142 388 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 EMDP50402 254 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PPT1P50897 306 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CD177Q8N6Q3 437 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 BEST4Q8NFU0 473 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SHC3Q92529 594 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MYLPFQ96A32 169 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TBX15Q96SF7 602 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 DUSP16Q9BY84 665 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 EHFQ9NZC4 300 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.39□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 CLRN2A0PK11 232 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 E9PLD3 99 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OR7A17O14581 309 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF208O43345 1280 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ADCY5O95622 1261 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 THY1P04216 161 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 BCKDHAP12694 445 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 PSMA2P25787 234 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GDF1P27539 372 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 OTX2P32243 289 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 VEGFCP49767 419 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 AIF1P55008 147 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RND3P61587 244 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 LMO4P61968 165 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 SLC25A52Q3SY17 297 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 TMEM110Q86TL2 294 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ERICH1Q86X53 443 aa3.38□□□□□ -1.87
SNAP23-205ENST00000563333 ZNF677Q86XU0 584 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms