RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 DKKL1Q9UK85 242 aa8.83□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.83□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 A0A087WZY1 265 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SERINC4A6NH21 518 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ALG1L2C9J202 215 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 H0YHG0 523 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 FXYD1O00168 92 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 AP3D1O14617 1153 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ZNF264O43296 627 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 HCRTR2O43614 444 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PEX1O43933 1283 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ICOSLGO75144 302 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 UGT2B11O75310 529 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 CBR3O75828 277 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ANGPTL1O95841 491 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 C8BP07358 591 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 NID1P14543 1247 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PRKAR1BP31321 381 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 MAP3K8P41279 467 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 KCNJ10P78508 379 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 CHRNEQ04844 493 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 FLOT2Q14254 428 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -13e-6■■■□□ 16.3
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CS-218ENST00000550159 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SPINK14Q6IE38 97 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ANKFN1Q8N957 763 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 FAM110BQ8TC76 370 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PSMF1Q92530 271 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 NR4A3Q92570 626 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SLC35B4Q969S0 331 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 TPD52L3Q96J77 140 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ZNF583Q96ND8 569 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 LDAHQ9H6V9 325 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 CMTM6Q9NX76 183 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 MED13LQ71F56 2210 aa8.82□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ERICH4A6NGS2 130 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 AGAP5A6NIR3 686 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 GJE1A6NN92 205 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 LINC01387J3KSC0 135 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 M0QX08 132 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 NME4O00746 187 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 GSC2O15499 205 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 NME2P1O60361 137 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 TRAPPC6AO75865 159 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 F10P00742 488 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PDGFAP04085 211 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 IFNW1P05000 195 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 LINGO3P0C6S8 592 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 T-ENOLP0DO92 83 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ZNF24P17028 368 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 NME2P22392 152 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 GDF1P27539 372 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 KDELR2P33947 212 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 CASP3P42574 277 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 HTR3AP46098 478 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 SMIM11AP58511 58 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 RBPJQ06330 500 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ZNF141Q15928 474 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 RNF220Q5VTB9 566 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
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CS-218ENST00000550159 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 CCDC80Q76M96 950 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 GALNT10Q86SR1 603 aa8.81□□□□□ -1
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CS-218ENST00000550159 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.81□□□□□ -1
CS-218ENST00000550159 RNF148Q8N7C7 305 aa8.81□□□□□ -1
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