RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A1B0GUL7	405 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	BICDL2	A1A5D9	508 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	EFCAB7	A8K855	629 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400		G3V3Y1	287 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400		H3BTX0	84 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC17A2	O00624	439 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CASK	O14936	926 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	OR4F21	O95013	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	GJB5	O95377	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	HSF2	Q03933	536 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRIP10	Q15642	601 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PARG	Q86W56	976 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	M1AP	Q8TC57	530 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	DHRS7	Q9Y394	339 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PXDN	Q92626	1479 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400		A8MX80	341 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PRAMEF12	O95522	483 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	AK1	P00568	194 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACVR1B	P36896	505 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	MTTP	P55157	894 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHI3L2	Q15782	390 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	UPRT	Q96BW1	309 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	VSTM2L	Q96N03	204 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CASD1	Q96PB1	797 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A1W2PP64	1363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	NRAP	Q86VF7	1730 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHRNA1	P02708	482 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SDC1	P18827	310 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	DLST	P36957	453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNF212	Q495C1	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	LGSN	Q5TDP6	509 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	VIT	Q6UXI7	678 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	MISP	Q8IVT2	679 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	NANP	Q8TBE9	248 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	USP54	Q70EL1	1684 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	TTC28	Q96AY4	2481 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	PEAK1	Q9H792	1746 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CTNNA1-222	ENST00000520400	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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