RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PDE5A	O76074	875 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C1QA	P02745	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	STATH	P02808	62 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ALPP	P05187	535 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LYN	P07948	512 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PCNA	P12004	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ICAM2	P13598	275 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PRF1	P14222	555 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	UQCRB	P14927	111 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	IL1RN	P18510	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ME2	P23368	584 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	JAK1	P23458	1154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MMP11	P24347	488 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ITGA3	P26006	1051 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PIK3R1	P27986	724 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	HNF4A	P41235	474 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ESRRG	P62508	458 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	REEP5	Q00765	189 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	DLG1	Q12959	904 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	DOC2A	Q14183	400 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LY6D	Q14210	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	FLOT2	Q14254	428 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PCLAF	Q15004	111 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PDK3	Q15120	406 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	C3orf18	Q9UK00	162 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	APC2	O95996	2303 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293		A6NL46	340 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293		A8MVJ9	347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	IDS	B3KWA1	339 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	UBD	O15205	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	P2RX6	O15547	441 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBM39-240	ENST00000495293	ITM2A	O43736	263 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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