RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CD99P14209 185 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CD53P19397 219 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 KLK2P20151 261 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ADAM8P78325 824 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 FGFBP1Q14512 234 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CHI3L2Q15782 390 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 SGCBQ16585 318 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 SMU1Q2TAY7 513 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB113Q30KQ7 82 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 OR5AK3PQ8NH89 298 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ZIM3Q96PE6 472 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM185BQ9H7F4 350 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 DLL4Q9NR61 685 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 EDARQ9UNE0 448 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ROS1P08922 2347 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ARID1AO14497 2285 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 WDR91A4D1P6 747 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 BIRC5O15392 142 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CXCL13O43927 109 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINE1P05121 402 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 POU2F1P14859 743 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 HPGDP15428 266 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CRYGSP22914 178 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 LOXP28300 417 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CLECL1Q8IZS7 167 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 OR2V1Q8NHB1 315 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTS15Q8TE58 950 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 OR7D2Q96RA2 312 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 AKTIPQ9H8T0 292 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 HAO1Q9UJM8 370 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 RAB21Q9UL25 225 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 TNFSF11O14788 317 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 SCN2BO60939 215 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 FOXF1Q12946 379 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 OR5D16Q8NGK9 328 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 MOAP1Q96BY2 351 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CHMP6Q96FZ7 201 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 STOML1Q9UBI4 398 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC4AQ9UMR7 237 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 PROCRQ9UNN8 238 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD28O15084 1053 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 NTN1O95631 604 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ATP12AP54707 1039 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 RPS26P62854 115 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PHC1P78364 1004 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 KEAP1Q14145 624 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFAF6Q330K2 333 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 OR4F3Q6IEY1 312 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF550Q7Z398 422 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC4FQ8N1N0 589 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 OR6K3Q8NGY3 331 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R36Q96LQ0 422 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SDF2Q99470 211 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 HOXD1Q9GZZ0 328 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 KCNE5Q9UJ90 142 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 CARD8Q9Y2G2 431 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 RAP2CQ9Y3L5 183 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ACTL7BQ9Y614 415 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ESPNB1AK53 854 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 C16orf97H3BN30 126 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 CASKO14936 926 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SOX30O94993 753 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 KRT16P08779 473 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SPDYE7PQ495Y7 208 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 LILRA2Q8N149 483 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SLC39A3Q9BRY0 314 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 TM9SF1O15321 606 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6V1C1P21283 382 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ELK4P28324 431 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 P2RX1P51575 399 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PGS1Q32NB8 556 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 HBMQ6B0K9 141 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms