RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TSLPQ969D9 159 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SDF2Q99470 211 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PRR14Q9BWN1 585 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PIGUQ9H490 435 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 APMAPQ9HDC9 416 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ERVK-19Q9WJR5 959 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 LIPT1Q9Y234 373 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.04■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PCDH17O14917 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FRS3O43559 492 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 IDH3BO43837 385 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PIP5K1AQ99755 562 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ACER3Q9NUN7 267 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF221Q9UK13 617 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CFL2Q9Y281 166 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 WDR45Q9Y484 360 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 A0A1B0GX78 115 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 LNP1A1A4G5 178 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SH3D21A4FU49 640 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 A6NL46 340 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MPZL2O60487 215 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ALPPP05187 535 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MSL3P1P0C860 447 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR2B6P58173 313 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MED22Q15528 200 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 COX18Q8N8Q8 333 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR4N2Q8NGD1 307 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 MVB12AQ96EY5 273 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CEP19Q96LK0 163 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR5M11Q96RB7 305 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa16.03■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CTDSP2O14595 271 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TPST2O60704 377 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 GADD45GO95257 159 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 POU2F1P14859 743 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 SLC15A1P46059 708 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 EMDP50402 254 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NNATQ16517 81 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 DCST2Q5T1A1 773 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF544Q6NX49 715 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 TP53INP1Q96A56 240 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC32Q9BV29 185 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CDCA4Q9BXL8 241 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 OR2B2Q9GZK3 357 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.02■□□□□ 0.16
PRRT4-205ENST00000489835 CCNB2O95067 398 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 RHCEP18577 417 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 HMGA2P52926 109 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 HOXC5Q00444 222 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ACY1Q03154 408 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 DSG2Q14126 1118 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 OR6F1Q8NGZ6 308 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 MGLLQ99685 303 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 FOLH1BQ9HBA9 442 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CLN6Q9NWW5 311 aa16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CTSFQ9UBX1 484 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms