RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474082.1

FAM3C-204, Transcript of family with sequence similarity 3 member C, human

TSL 2

Gene FAM3C, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM3C-204	ENST00000474082	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082		K7EQM0	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	UBXN8	O00124	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	GMFG	O60234	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CD47	Q08722	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	FAM3C	Q92520	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082		Q9UF83	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PHOX2A	O14813	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SPAG6	O75602	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	UGT2B4	P06133	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PPT1	P50897	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	LAGE3	Q14657	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	UTF1	Q5T230	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082		Q6ZR54	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	RIT2	Q99578	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CITED1	Q99966	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082		H3BMQ9	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082		K7ENP7	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	AP3B1	O00203	1094 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	ADCY5	O95622	1261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	HPCAL1	P37235	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	STAR	P49675	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SULT1E1	P49888	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CBX1	P83916	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	RAB40B	Q12829	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CHIT1	Q13231	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	RIPK1	Q13546	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	SYPL1	Q16563	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	OMD	Q99983	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	BTN3A3	O00478	584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	MAGEB3	O15480	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	GPX5	O75715	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	HNF1A	P20823	631 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	GLRA2	P23416	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM3C-204	ENST00000474082	PEX19	P40855	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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