RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 TJP1Q07157 1748 aa13.64□□□□□ -0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 FBXL2Q9UKC9 423 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 CHATP28329 748 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 DLX5P56178 289 aa13.62□□□□□ -0.23
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