RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403027.6

CNOT8-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-202ENST00000403027 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 BRINP1O60477 761 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SLC35E2P0CK97 266 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 FZD5Q13467 585 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NR4A3Q92570 626 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 OTULINQ96BN8 352 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CEP19Q96LK0 163 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 STACQ99469 402 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NEK6Q9HC98 313 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TIGARQ9NQ88 270 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SATB2Q9UPW6 733 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TAF4O00268 1085 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SURF4O15260 269 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SDC3O75056 442 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CSF2P04141 144 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 FXYD6P3P58550 94 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 INSL4Q14641 139 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NNATQ16517 81 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SMUG1Q53HV7 270 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 OSTF1Q92882 214 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 THADAQ6YHU6 1953 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 IGKV1D-16P01601 117 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 MAKP20794 623 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 STAT5AP42229 794 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 GFERP55789 205 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 COPZ1P61923 177 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 BAK1Q16611 211 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 EIPR1Q53HC9 387 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 C22orf42Q6IC83 251 aa14.53□□□□□ -0.08
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CNOT8-202ENST00000403027 TM9SF2Q99805 663 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 FOXQ1Q9C009 403 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 DYRK3O43781 588 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 MAOAP21397 527 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CD38P28907 300 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SOX6P35712 828 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 EMDP50402 254 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 PRKCDQ05655 676 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 RAB40BQ12829 278 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 STX4Q12846 297 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CCDC190Q86UF4 302 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CDRT1O95170 752 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 LIMS3P0CW19 117 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 LIMS4P0CW20 117 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 MYL12AP19105 171 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 GCGRP47871 477 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 CDH11P55287 796 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 ELOCQ15369 112 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 KLHL22Q53GT1 634 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 RNLSQ5VYX0 342 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 GRHL3Q8TE85 626 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TMEM239Q8WW34 195 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SLC38A3Q99624 504 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 UBQLN3Q9H347 655 aa14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CNOT8-202ENST00000403027 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.52□□□□□ -0.08
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