RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SELENOFO60613 162 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SEMA7AO75326 666 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 OAZ2O95190 189 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SMIM6P0DI80 62 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 KCNJ5P48544 419 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 EPHA4P54764 986 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 Q3ZCU0 254 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 C9orf152Q5JTZ5 239 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 RPTNQ6XPR3 784 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 PGAP1Q75T13 922 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 LNX2Q8N448 690 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 MED20Q9H944 212 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 PRAMEF4O60810 478 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 RECKO95980 971 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SYPL1Q16563 259 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 UPP1Q16831 310 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00303Q3SY05 128 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 XKR4Q5GH76 650 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 STOML3Q8TAV4 291 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SGK3Q96BR1 496 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 GAREM1Q9H706 876 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 P2RX2Q9UBL9 471 aa11.5□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF879B4DU55 563 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 FADS1O60427 444 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SLC2A10O95528 541 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 HPP00738 406 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ATP1B1P05026 303 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 HSD3B2P26439 372 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 PTH2RP49190 550 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 CLDN12P56749 244 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 OR2T33Q8NG76 320 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 GPR32P1Q8NGA4 272 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 OR11G2Q8NGC1 345 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 OR8S1Q8NH09 359 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 THAP4Q8WY91 577 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 S100PBPQ96BU1 408 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 PTHLHP12272 177 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 CSF2RBP32927 897 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 RAB2AP61019 212 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 TRAM2Q15035 370 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 KLHL26Q53HC5 615 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SSX9Q7RTT3 188 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 VRK3Q8IV63 474 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 CXorf36Q9H7Y0 433 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 TAS2R5Q9NYW4 299 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 AHSPQ9NZD4 102 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 MYLKQ15746 1914 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ARID1AO14497 2285 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 RPL17P18621 184 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 AGTR1P30556 359 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.49□□□□□ -0.57
SZRD1-201ENST00000401088 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms