RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF136P52737 540 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF836Q6ZNA1 936 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PEX5LQ8IYB4 626 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL36Q8N4N3 616 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2T33Q8NG76 320 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52N1Q8NH53 320 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM10Q96HG1 83 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DEPDC7Q96QD5 511 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 JAM3Q9BX67 310 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 IL20RAQ9UHF4 553 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC7A7Q9UM01 511 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CASKO14936 926 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SDC3O75056 442 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 UGT2B7P16662 529 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CPN2P22792 545 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP3R1P63098 170 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FZD5Q13467 585 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP5Q16690 384 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4K14Q8NGD5 310 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TM4SF19Q96DZ7 209 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ARSGQ96EG1 525 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0B4J293 547 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 A6NCN8 305 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 J3QRE1 110 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-DQB1P01920 261 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HMGN1P05114 100 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CELP19835 753 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP8Q13202 625 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 VASNQ6EMK4 673 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5T3Q8NGG3 340 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RSC1A1Q92681 617 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SAMD8Q96LT4 415 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SDF2Q99470 211 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TMED9Q9BVK6 235 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HDHD5Q9BXW7 423 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 COMMD3Q9UBI1 195 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF11Q9UIL8 331 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CHST10O43529 356 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-DPB1P04440 258 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PTNP21246 168 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SSTR4P31391 388 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FREM2Q5SZK8 3169 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 NOXA1Q86UR1 476 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS27Q9BQR3 290 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM246Q9BRR3 403 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TTYH2Q9BSA4 534 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 UBQLN3Q9H347 655 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HRASLS2Q9NWW9 162 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CPNE7Q9UBL6 633 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 BOLA1Q9Y3E2 137 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SHISA3A0PJX4 238 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 GABRPO00591 440 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SOCS6O14544 535 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35G6P0C7Q6 338 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-DMAP28067 261 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFS1P28331 727 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RUNX2Q13950 521 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CPOQ8IVL8 374 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SERINC2Q96SA4 455 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ATF6BQ99941 703 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 RBCK1Q9BYM8 510 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D17Q9HA65 648 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB6Q9NWX5 421 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2W5A6NFC9 320 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CSF2P04141 144 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 THBS1P07996 1170 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZGLP1P0C6A0 271 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MAZP56270 477 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FZD2Q14332 565 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2A5Q96R48 311 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FBRSQ9HAH7 460 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PTGFRNQ9P2B2 879 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HCN1O60741 890 aa17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms