RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 STX11O75558 287 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TGM6O95932 706 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KHKP50053 298 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CLDN20P56880 219 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PHC1P78364 1004 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF117Q03924 483 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 RNF145Q96MT1 663 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 OR52E6Q96RD3 313 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PANX1Q96RD7 426 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SDF2Q99470 211 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 OR51I1Q9H343 314 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 JKAMPQ9P055 326 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 MED12Q93074 2177 aa14.48□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1W2PNV4 684 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 H0YC42 278 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PGRP06401 933 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 P2RX1P51575 399 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CLDN15P56746 228 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SORDQ00796 357 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FGFBP1Q14512 234 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PON3Q15166 354 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GPR68Q15743 365 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GSTA3Q16772 222 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SAXO2Q658L1 398 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FAM222BQ8WU58 562 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NEURL3Q96EH8 262 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TEX37Q96LM6 180 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CREBBPQ92793 2442 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 DIAPH2O60879 1101 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SLC22A3O75751 556 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 OR12D1P0DN82 309 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 UBL4AP11441 157 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ELK4P28324 431 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CASP9P55211 416 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 RAC1P63000 192 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 HPCAP84074 193 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.099e-11■■□□□ 13.2
ATG4B-201ENST00000344376 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 LUZP2Q86TE4 346 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GGNQ86UU5 652 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FIG4Q92562 907 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 POLE3Q9NRF9 147 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.47□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SERINC4A6NH21 518 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC154A6NI56 674 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 C9JVG2 144 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 UBDO15205 165 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF264O43296 627 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SYNGR4O95473 234 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 IL6P05231 212 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 LINGO3P0C6S8 592 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CCR4P51679 360 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KRTAP10-9P60411 292 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 C7orf26Q96N11 449 aa14.46□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.2 ms