RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 RHCGQ9UBD6 479 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PROM1O43490 865 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CPN2P22792 545 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 DOC2BQ14184 412 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 YIF1BQ5BJH7 314 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMAT1Q5H9K5 638 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PGBD2Q6P3X8 592 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 NXPE4Q6UWF7 544 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7G1Q8NGA0 311 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A18Q96BI1 424 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TAAR9Q96RI9 348 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A16Q9GZN6 736 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRA2Q9H9E1 313 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCB9Q9NP78 766 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TIGARQ9NQ88 270 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 AP3D1O14617 1153 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCC2O75069 709 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCY1B2O75343 617 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DQB1P01920 261 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 GAAP10253 952 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ERP29P30040 261 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG2P59768 71 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FIGLAQ6QHK4 219 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 KMT5CQ86Y97 462 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC38A5Q8WUX1 472 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A11Q8WWX8 675 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 DIRAS2Q96HU8 199 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FUZQ9BT04 418 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE7BQ9NP56 450 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MAU2Q9Y6X3 613 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 B4DXG7 233 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSVO60911 334 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL18O94889 574 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFB1P01137 390 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK1P06870 262 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CSF3P09919 207 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL12AP19105 171 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRA4P48169 554 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 QPRTQ15274 297 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TGIF1Q15583 401 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN1P1Q5VSP4 162 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 IGF2-ASQ6U949 168 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 LAPTM4BQ86VI4 370 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 DPH7Q9BTV6 452 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM129A0AVI4 362 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 IL3P08700 152 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 NR2F6P10588 404 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SDC2P34741 201 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B2P37059 387 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ5P48544 419 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP3R1P63098 170 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC23BQ15437 767 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPKQ5VXJ0 399 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CARFQ8N187 725 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEANCQ8N8B7 351 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 COQ7Q99807 217 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MIXL1Q9H2W2 232 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51B5Q9H339 312 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf36Q9H7Y0 433 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 RAXQ9Y2V3 346 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MGAQ8IWI9 3026 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRQ8 180 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN19P0C672 248 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT4P56705 351 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TPBGQ13641 420 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF12Q5T6F0 453 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MZT2BQ6NZ67 158 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1L3Q8NH93 324 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ENKURQ8TC29 256 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 DDCP20711 480 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB40BQ12829 278 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SLAMF1Q13291 335 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR32P1Q8NGA4 272 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52I1Q8NGK6 324 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TCTN2Q96GX1 697 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM19Q96HH6 336 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA3GQ9NS98 782 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF11Q9UIL8 331 aa24.41■■□□□ 1.5
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