RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 SGCDQ92629 289 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 HAS2Q92819 552 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 MUL1Q969V5 352 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 MOAP1Q96BY2 351 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 EPYCQ99645 322 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 PITX2Q99697 317 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 MFRPQ9BY79 579 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 A0A1B0GVG6 124 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 A8MVJ9 347 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 TO15178 435 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 UGT2B11O75310 529 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEURL1O76050 574 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 FBXO45P0C2W1 286 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 DRD5P21918 477 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 MATN1P21941 496 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 UQCRC2P22695 453 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAP3K8P41279 467 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYB561P49447 251 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 TNFSF10P50591 281 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMBIM6P55061 237 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 CXCR4P61073 352 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 HPCAP84074 193 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 FADDQ13158 208 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDK5R2Q13319 367 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 OR1C1Q15619 314 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEDD8Q15843 81 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 COLEC12Q5KU26 742 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 COX20Q5RI15 118 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 GPR107Q5VW38 600 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SAXO2Q658L1 398 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC6A19Q695T7 634 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 OPN5Q6U736 354 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 Q6ZS92 163 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAGAPQ8N103 731 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SETD9Q8NE22 299 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC9A6Q92581 669 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 HES7Q9BYE0 225 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 OCEL1Q9H607 264 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 HPF1Q9NWY4 346 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRFN1Q9P244 771 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 U3KQV3 271 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATMQ13315 3056 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDK2AP1O14519 115 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 SUV39H1O43463 412 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 NKX2-2O95096 273 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCMT1P22061 227 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 ABCD3P28288 659 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAN2A2P49641 1150 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRIM2P49643 509 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 ARHGDIAP52565 204 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 CASP9P55211 416 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 NRG3P56975 720 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 DUSP5Q16690 384 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPINK14Q6IE38 97 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDC73Q6P1J9 531 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms