RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000095500.4

Ccdc78-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ccdc78, Length 1,651 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm15013V9GWY0 266 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa9.97□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm14147A2AQX6 640 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm14443A2ARX0 610 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm45711E0CXA2 391 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Prr36E9PV26 1098 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Macc1E9PXX8 851 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm21820J3KMU2 361 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Asna1O54984 348 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Csf1P07141 552 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Hcrtr2P58308 460 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 EpycP70186 322 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 PamP97467 979 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 VldlrP98156 873 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Yy2Q3TTC2 378 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 TraddQ3U0V2 310 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mfsd12Q3U481 476 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr463Q5SW49 311 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr462Q5SW50 311 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Kcnh1Q60603 989 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Abhd17bQ7M759 288 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rassf6Q80UQ2 353 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Catsper3Q80W99 395 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Snx32Q80ZJ7 404 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mfsd8Q8BH31 519 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Clrn3Q8BHH8 226 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zfp763Q8BIC7 588 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pou6f2Q8BJI4 691 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cxcl16Q8BSU2 246 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm9938Q8C3P5 112 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sorcs3Q8VI51 1219 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 UmodQ91X17 642 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Def8Q99J78 448 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cisd2Q9CQB5 135 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pdzk1Q9JIL4 519 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Galnt16Q9JJ61 558 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Trank1Q8BV79 2999 aa9.96□□□□□ -0.81
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mllt6B1AR10 1109 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Fam71dD3YV92 440 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cd209fD3Z1H5 274 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zfp97E9PZP6 546 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Il20rbE9Q9A6 308 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm42421F6X8D5 166 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm8922F6XVS9 199 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zfp960L7N267 546 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Capn1O35350 713 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sh3pxd2aO89032 1124 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Itga5P11688 1053 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Akr1b7P21300 316 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cnr1P47746 473 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Hrh3P58406 445 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 CtseP70269 397 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 MpgQ04841 333 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Calb2Q08331 271 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Bcl2l15Q08ED0 167 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mrgprb2Q3KNA1 338 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Jsrp1Q3MI48 332 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pate2Q3UW31 111 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tmem158Q6F5E0 286 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tas2r107Q7M725 308 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Syt16Q7TN83 639 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Oog2Q7TPX8 476 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr1288Q7TQY0 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr406Q7TRX0 323 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Dusp28Q8BTR5 163 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Slc46a2Q8CA03 479 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Neurl3Q8CJC5 254 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vmn1r205Q8R276 316 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mrgpra3Q91WW3 302 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tstd3Q9D0B5 157 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cysrt1Q9D1E4 142 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 4930513O06RikQ9D549 161 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Lgi1Q9JIA1 557 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 MNCb-2990Q9JJ93 142 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tuba8Q9JJZ2 449 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mapk11Q9WUI1 364 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Srd5a3Q9WUP4 330 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cxcl15Q9WVL7 167 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa9.96□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ankrd12G5E893 2041 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm20489A2AGH5 449 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rad21l1A2AU37 552 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 4931406B18RikA2RSL7 367 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr750E9Q0Z1 331 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Adamts3E9Q287 1204 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr209L7N1X3 305 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zfp37P17141 594 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 RcvrnP34057 202 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mbl1P39039 239 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pla2g2cP48076 150 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Aqp4P55088 323 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ackr3P56485 362 aa9.95□□□□□ -0.82
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 NrgnP60761 78 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.5 ms