Protein–RNA interactions for Protein: Q3U481

Mfsd12, Major facilitator superfamily domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd12Q3U481 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Mfsd12Q3U481 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Mfsd12Q3U481 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Mfsd12Q3U481 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Mfsd12Q3U481 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Mfsd12Q3U481 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Mfsd12Q3U481 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Mfsd12Q3U481 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mfsd12Q3U481 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Mfsd12Q3U481 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Mfsd12Q3U481 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Mfsd12Q3U481 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mfsd12Q3U481 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mfsd12Q3U481 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Mfsd12Q3U481 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mfsd12Q3U481 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mfsd12Q3U481 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mfsd12Q3U481 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mfsd12Q3U481 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mfsd12Q3U481 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mfsd12Q3U481 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mfsd12Q3U481 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mfsd12Q3U481 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mfsd12Q3U481 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mfsd12Q3U481 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mfsd12Q3U481 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Mfsd12Q3U481 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mfsd12Q3U481 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mfsd12Q3U481 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mfsd12Q3U481 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfsd12Q3U481 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mfsd12Q3U481 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mfsd12Q3U481 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mfsd12Q3U481 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mfsd12Q3U481 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mfsd12Q3U481 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mfsd12Q3U481 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mfsd12Q3U481 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Mfsd12Q3U481 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mfsd12Q3U481 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mfsd12Q3U481 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mfsd12Q3U481 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mfsd12Q3U481 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mfsd12Q3U481 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mfsd12Q3U481 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Mfsd12Q3U481 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mfsd12Q3U481 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mfsd12Q3U481 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mfsd12Q3U481 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mfsd12Q3U481 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mfsd12Q3U481 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mfsd12Q3U481 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mfsd12Q3U481 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mfsd12Q3U481 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mfsd12Q3U481 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mfsd12Q3U481 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mfsd12Q3U481 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mfsd12Q3U481 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mfsd12Q3U481 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mfsd12Q3U481 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Mfsd12Q3U481 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mfsd12Q3U481 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mfsd12Q3U481 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mfsd12Q3U481 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mfsd12Q3U481 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mfsd12Q3U481 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mfsd12Q3U481 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mfsd12Q3U481 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Mfsd12Q3U481 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Mfsd12Q3U481 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mfsd12Q3U481 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mfsd12Q3U481 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mfsd12Q3U481 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mfsd12Q3U481 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mfsd12Q3U481 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mfsd12Q3U481 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mfsd12Q3U481 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mfsd12Q3U481 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mfsd12Q3U481 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mfsd12Q3U481 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mfsd12Q3U481 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mfsd12Q3U481 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mfsd12Q3U481 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mfsd12Q3U481 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mfsd12Q3U481 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mfsd12Q3U481 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mfsd12Q3U481 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mfsd12Q3U481 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mfsd12Q3U481 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mfsd12Q3U481 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mfsd12Q3U481 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mfsd12Q3U481 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mfsd12Q3U481 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mfsd12Q3U481 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mfsd12Q3U481 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mfsd12Q3U481 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mfsd12Q3U481 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mfsd12Q3U481 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mfsd12Q3U481 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mfsd12Q3U481 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms