RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Micu1Q8VCX5 477 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1393Q8VFA7 311 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr649Q8VGW1 312 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 UmodQ91X17 642 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NcaldQ91X97 193 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 2610042L04RikQ9D073 150 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hormad1Q9D5T7 392 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plod2Q9R0B9 737 aa20.07■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm12666A2AMD0 254 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1097A2AVA9 315 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1056A2AVY0 313 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm45711E0CXA2 391 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp97E9PZP6 546 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21820J3KMU2 361 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FaimlJ3QPY3 178 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp960L7N267 546 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AmacrO09174 381 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scarb2O35114 478 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfand5O88878 213 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akr1b7P21300 316 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pax7P47239 503 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pla2g2cP48076 150 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RptnP97347 1118 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RykQ01887 594 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 UbqlnlQ14DL0 610 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fthl17dQ3SXD1 176 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mfsd12Q3U481 476 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbbp4Q60972 425 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gstt2Q61133 244 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Opn5Q6VZZ7 377 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aldh3b1Q80VQ0 468 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acsm4Q80W40 580 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lhfpl6Q8BM86 200 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CcsapQ8QZT2 252 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NrmQ8VC65 262 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr61Q8VGM2 311 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EtfaQ99LC5 333 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fthl17Q99MX2 176 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9CYS6 286 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Upk1aQ9D132 257 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Echdc3Q9D7J9 300 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cib4Q9D9N5 185 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lyzl6Q9DA11 148 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fads3Q9JJE7 449 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acss2Q9QXG4 701 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DstnQ9R0P5 165 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcne3Q9WTW2 103 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm884A2A9H6 3643 aa20.06■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PtprbB2RU80 1998 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OtcP11725 354 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpx5P21765 221 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col28a1Q2UY11 1141 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FaddQ61160 205 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdk6Q64261 326 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gramd2bQ6PEM6 445 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nabp1Q8BGW5 198 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MepceQ8K3A9 666 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r28Q8R2C9 302 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MlycdQ99J39 492 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pacsin3Q99JB8 424 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gstt3Q99L20 241 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc29a3Q99P65 475 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cisd2Q9CQB5 135 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stx11Q9D3G5 287 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9DAS2 200 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gsk3bQ9WV60 420 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Racgap1Q9WVM1 628 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdh20Q9Z0M3 801 aa20.05■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp442A2AQA0 667 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1179A2AUS6 307 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd101A8E0Y8 1033 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10639E9Q6L7 222 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tgfb1P04202 390 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gsta2P10648 222 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr1cP52432 346 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HpcaP84075 193 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp22Q5DU02 525 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ShhQ62226 437 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snrnp40Q6PE01 358 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DcstampQ7TNJ0 470 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1318Q7TQW6 320 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SargQ8BI29 606 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp763Q8BIC7 588 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Catsper4Q8BVN3 442 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Unc5dQ8K1S2 956 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxo45Q8K3B1 286 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kctd11Q8K485 232 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pex12Q8VC48 359 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hsd17b13Q8VCR2 304 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1317Q8VF84 316 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gmpr2Q99L27 348 aa20.04■□□□□ 0.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gkn3Q9D0T7 191 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.3 ms