RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GKN3PP0CG01 181 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PRG2P13727 222 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DGCR6Q14129 220 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FNDC7Q5VTL7 733 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DESI1Q6ICB0 168 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FAHD1Q6P587 224 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TAGAPQ8N103 731 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF570Q96NI8 536 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CTPS2Q9NRF8 586 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C70A6NIJ9 312 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 FMO6PO60774 539 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ICOSLGO75144 302 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 NADKO95544 446 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SNAP29O95721 258 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 THRBP10828 461 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 OTX2P32243 289 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R41P59536 307 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM4DQ6B0I6 523 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 IGF2-ASQ6U949 168 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10G2Q8NGC3 310 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOTQ9UBF9 498 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ARRDC5A6NEK1 342 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 WWP2O00308 870 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SCDO00767 359 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 NGFRP08138 427 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MERTKQ12866 999 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FGD3Q5JSP0 725 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DCST1Q5T197 706 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 APOOLQ6UXV4 268 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TFAP2CQ92754 450 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 NKD1Q969G9 470 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ADI1Q9BV57 179 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCC3Q9ULS5 477 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.87■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP54Q96N23 3096 aa22.87■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 UGT2B11O75310 529 aa22.87■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCNB2O95067 398 aa22.87■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 HPGDP15428 266 aa22.87■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 HTR2AP28223 471 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ST3GAL3Q11203 375 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa22.87■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 ATG16L2Q8NAA4 619 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM71CQ8NEG0 241 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A13Q8TCU3 470 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FEVQ99581 238 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 Q9H521 79 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.87■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 CYP7B1O75881 506 aa22.86■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC23BQ15437 767 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A8Q8N695 610 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD19PQ9H560 264 aa22.86■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQD3 144 aa22.85■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 GFRA3O60609 400 aa22.85■■□□□ 1.25
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CAPNS1-215ENST00000628018 HPP00738 406 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 THY1P04216 161 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD23AP54725 363 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 EPS8Q12929 822 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MED21Q13503 144 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 IL10RAQ13651 578 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CD226Q15762 336 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 RFX4Q33E94 735 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC36A3Q495N2 470 aa22.85■■□□□ 1.25
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