RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	NUDT14	O95848	222 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	HOXC12	P31275	282 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	MAP3K8	P41279	467 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	DUSP5	Q16690	384 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	HBM	Q6B0K9	141 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	BEND4	Q6ZU67	534 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	GATS	Q8NAP1	163 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	OR2T11	Q8NH01	316 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	OR10D3	Q8NH80	312 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	FBXO30	Q8TB52	745 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CCL19	Q99731	98 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PIGU	Q9H490	435 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	MTOR	P42345	2549 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743		B4DXG7	233 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PIP5K1B	O14986	540 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CFLAR	O15519	480 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PEX11A	O75192	247 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CGA	P01215	116 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	IGKV1D-16	P01601	117 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	INHBB	P09529	407 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ACP2	P11117	423 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	IL11	P20809	199 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ALDH3A1	P30838	453 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	NR1H2	P55055	460 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CARD18	P57730	90 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ACKR1	Q16570	336 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	APOOL	Q6UXV4	268 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	TRABD2A	Q86V40	505 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	BANP	Q8N9N5	519 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	FAM110B	Q8TC76	370 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	POM121	Q96HA1	1249 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	RNF145	Q96MT1	663 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	MED17	Q9NVC6	651 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	DUXA	A6NLW8	204 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ADAMDEC1	O15204	470 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CXCL13	O43927	109 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	AQP8	O94778	261 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	TUBB	P07437	444 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PRPS1L1	P21108	318 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ELK4	P28324	431 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ADH6	P28332	368 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF385B	Q569K4	471 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	BEX5	Q5H9J7	111 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CDC73	Q6P1J9	531 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	GALNT10	Q86SR1	603 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	GGN	Q86UU5	652 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	LILRA2	Q8N149	483 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	AGR3	Q8TD06	166 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	OSTF1	Q92882	214 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	GIMAP5	Q96F15	307 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL15	Q96M94	604 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	NGB	Q9NPG2	151 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	DLL4	Q9NR61	685 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GGA3-208	ENST00000579743	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		12.3	□□□□□ -0.44

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