RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDH17O14917 1159 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 Q0VFX4 171 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 VASH2Q86V25 355 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 SVOPLQ8N434 492 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 NACC2Q96BF6 587 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 EPYCQ99645 322 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 TNFRSF11BO00300 401 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ICOSLGO75144 302 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT2B11O75310 529 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 FPR1P21462 350 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 FGFBP1Q14512 234 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 BROXQ5VW32 411 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF597Q96LX8 424 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 MYOTQ9UBF9 498 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 MAN1A2O60476 641 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 THY1P04216 161 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 M1APQ8TC57 530 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 OSBPL10Q9BXB5 764 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 RAXQ9Y2V3 346 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 IGF2RP11717 2491 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 SERINC4A6NH21 518 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAMDEC1O15204 470 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 NTN1O95631 604 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 ALPLP05186 524 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 TBXA2RP21731 343 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP2R2BQ00005 443 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 CD226Q15762 336 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 EXT1Q16394 746 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 LYPD8Q6UX82 237 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 GATSQ8NAP1 163 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 FUZQ9BT04 418 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 MMP25Q9NPA2 562 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXL4Q9UKA2 621 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 OIP5O43482 229 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 OR2J2O76002 312 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 GADD45GO95257 159 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 HTR2AP28223 471 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 DAPP51397 102 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PNLIPRP2P54317 469 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 DAG1Q14118 895 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 SEC23BQ15437 767 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 EIPR1Q53HC9 387 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP4Z1Q86W10 505 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 MCHR1Q99705 422 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 P4HTMQ9NXG6 502 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-209ENST00000532457 C17orf51A8MQB3 221 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 IL12BP29460 328 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 UCNP55089 124 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 9.2
PACSIN3-209ENST00000532457 ENTPD8Q5MY95 495 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 NRBF2Q96F24 287 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHDC3Q9BQ90 382 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 H0YJX3 145 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAM10O14672 748 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 ITGAMP11215 1152 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-209ENST00000532457 ALDH3A2P51648 485 aa20.13■□□□□ 0.81
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