RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 DDIASQ8IXT1 998 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 MORN4Q8NDC4 146 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 OR2L5Q8NG80 312 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 RND1Q92730 232 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 NCLNQ969V3 563 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 WDR34Q96EX3 536 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 VPS39Q96JC1 886 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 HPF1Q9NWY4 346 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 HEY2Q9UBP5 337 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 RNF6Q9Y252 685 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 WDR1O75083 606 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 TOXO94900 526 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 HLA-DQA2P01906 255 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CSF1P09603 554 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINB1P30740 379 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ARFIP1P53367 373 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 MTTPP55157 894 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP10-9P60411 292 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 BIKQ13323 160 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CES4AQ5XG92 561 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 OPN5Q6U736 354 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 HSDL2Q6YN16 418 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 OR2M7Q8NG81 312 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 KAT2AQ92830 837 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 MS4A14Q96JA4 679 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 QRFPRQ96P65 431 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 RASL10BQ96S79 203 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 SERINC2Q96SA4 455 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 DERL2Q9GZP9 239 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 AICDAQ9GZX7 198 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 RHBGQ9H310 441 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL31Q9H511 634 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 LYRM4Q9HD34 91 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 THAP1Q9NVV9 213 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 SNX12Q9UMY4 172 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 GTF3C1Q12789 2109 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 MED13LQ71F56 2210 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC189A1A4V9 331 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM247A6NEH6 219 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 E7ESA3 106 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CDC7O00311 574 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 SOCS2O14508 198 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 STX16O14662 325 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 KLK8O60259 260 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 HCN1O60741 890 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CTNSO60931 367 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJB6O75190 326 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 OR2J2O76002 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 GOSR1O95249 250 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 LYL1P12980 280 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 CYP4B1P13584 511 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-222ENST00000514552 COX7A2P14406 83 aa6.19□□□□□ -1.42
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